Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ankrd53Q3V0J4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms