Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D130052B06RikQ3UW13 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms