Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms