Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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