Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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