Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm648Q3UJ22 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms