Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx27Q3UHD6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx27Q3UHD6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx27Q3UHD6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx27Q3UHD6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx27Q3UHD6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx27Q3UHD6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx27Q3UHD6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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