Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rnf180Q3U827 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rnf180Q3U827 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rnf180Q3U827 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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