Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U595 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U595 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U595 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U595 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U595 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U595 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U595 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms