Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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