Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pnpla6Q3TRM4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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