Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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