Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc10Q3TLI0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms