Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms