Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam178bQ24JP3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms