Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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