Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Cers3Q1A3B0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms