Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms