Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms