Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp2Q08652 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms