Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms