Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms