Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms