Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms