Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms