Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms