Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms