Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms