Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms