Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms