Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms