Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms