Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms