Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms