Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F8a1Q00558 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms