Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms