Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms