Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms