Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb2P81069 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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