Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx2P80206 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx2P80206 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms