Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb1P70662 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb1P70662 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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