Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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