Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprvP70289 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprvP70289 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprvP70289 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprvP70289 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprvP70289 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprvP70289 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprvP70289 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprvP70289 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms