Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms