Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Acta1P68134 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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