Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp46P62069 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms