Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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