Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2nP61089 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2nP61089 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms