Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms