Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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